本校の生徒は遠方から通学する生徒も多く、そのほとんどがバス通学です。

そのうち、(株)長崎バス様の路線バスにおいて、長崎明誠高校敷地内まで運行してくださっているバスを本校では「スクールバス」と呼んでいます。
公共交通機関を利用するにあたり、本校の取り組みとして、生徒たち自身で運営する「バス路線別集会」を定期的に実施し、お互いのバスの乗車マナー状況やバス停の利用を確認しています。